Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfp839E9PUU5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp839E9PUU5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp839E9PUU5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms