Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptrhd1D3Z4S3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptrhd1D3Z4S3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptrhd1D3Z4S3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms