Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim30cD3YVI9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim30cD3YVI9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim30cD3YVI9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms