Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc13D3YV10 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc13D3YV10 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc13D3YV10 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms