Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hacd4A2AKM2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hacd4A2AKM2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hacd4A2AKM2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hacd4A2AKM2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms