Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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