Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TK1P04183 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TK1P04183 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TK1P04183 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TK1P04183 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TK1P04183 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TK1P04183 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TK1P04183 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TK1P04183 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TK1P04183 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TK1P04183 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TK1P04183 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TK1P04183 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TK1P04183 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TK1P04183 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TK1P04183 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TK1P04183 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TK1P04183 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TK1P04183 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TK1P04183 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TK1P04183 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TK1P04183 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms