Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TK1P04183 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TK1P04183 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TK1P04183 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms