Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB3Q9UKI3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.3 ms