Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPB1P53618 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPB1P53618 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPB1P53618 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPB1P53618 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPB1P53618 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPB1P53618 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPB1P53618 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPB1P53618 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPB1P53618 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPB1P53618 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPB1P53618 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPB1P53618 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPB1P53618 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms