Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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