Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3bgrQ9WUZ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Sh3bgrQ9WUZ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sh3bgrQ9WUZ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms