Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma4Q9R1P0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Psma4Q9R1P0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma4Q9R1P0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms