Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod2Q9R0B9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod2Q9R0B9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod2Q9R0B9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms