Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr2e3Q9QXZ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr2e3Q9QXZ7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr2e3Q9QXZ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms