Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rcan3Q9JKK0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rcan3Q9JKK0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rcan3Q9JKK0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rcan3Q9JKK0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rcan3Q9JKK0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rcan3Q9JKK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rcan3Q9JKK0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rcan3Q9JKK0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rcan3Q9JKK0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rcan3Q9JKK0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms