Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms