Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slco1c1Q9ERB5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slco1c1Q9ERB5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms