Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx12Q9ER00 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx12Q9ER00 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx12Q9ER00 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms