Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox9Q9EQM5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhox9Q9EQM5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox9Q9EQM5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms