Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Upf1Q9EPU0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Upf1Q9EPU0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Upf1Q9EPU0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Upf1Q9EPU0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Upf1Q9EPU0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Upf1Q9EPU0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Upf1Q9EPU0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Upf1Q9EPU0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms