Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifrd2Q9D8U0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifrd2Q9D8U0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifrd2Q9D8U0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifrd2Q9D8U0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifrd2Q9D8U0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifrd2Q9D8U0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ifrd2Q9D8U0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd2Q9D8U0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd2Q9D8U0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd2Q9D8U0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd2Q9D8U0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifrd2Q9D8U0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifrd2Q9D8U0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifrd2Q9D8U0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifrd2Q9D8U0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifrd2Q9D8U0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.6 ms