Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D7E4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D7E4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D7E4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D7E4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D7E4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D7E4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D7E4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D7E4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D7E4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D7E4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms