Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl53Q9D1H8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl53Q9D1H8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms