Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkrip1Q9CWV6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prkrip1Q9CWV6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prkrip1Q9CWV6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prkrip1Q9CWV6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prkrip1Q9CWV6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms