Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg12Q9CQY1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg12Q9CQY1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg12Q9CQY1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms