Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PsenenQ9CQR7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PsenenQ9CQR7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PsenenQ9CQR7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PsenenQ9CQR7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PsenenQ9CQR7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PsenenQ9CQR7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PsenenQ9CQR7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PsenenQ9CQR7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PsenenQ9CQR7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PsenenQ9CQR7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PsenenQ9CQR7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PsenenQ9CQR7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PsenenQ9CQR7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms