Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim8Q9CQQ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim8Q9CQQ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim8Q9CQQ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms