Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim8Q99PJ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim8Q99PJ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms