Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab4bQ91ZR1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab4bQ91ZR1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab4bQ91ZR1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab4bQ91ZR1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab4bQ91ZR1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms