Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6Q8K3P5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot6Q8K3P5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot6Q8K3P5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms