Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fam228aQ8CDW1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam228aQ8CDW1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam228aQ8CDW1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms