Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aph1bQ8C7N7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aph1bQ8C7N7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aph1bQ8C7N7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Aph1bQ8C7N7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aph1bQ8C7N7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aph1bQ8C7N7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aph1bQ8C7N7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aph1bQ8C7N7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aph1bQ8C7N7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aph1bQ8C7N7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aph1bQ8C7N7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aph1bQ8C7N7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aph1bQ8C7N7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aph1bQ8C7N7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aph1bQ8C7N7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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