Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLE7

Slc17a6, Vesicular glutamate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a6Q8BLE7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a6Q8BLE7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc17a6Q8BLE7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a6Q8BLE7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 925 ms