Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy1Q8BIJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rufy1Q8BIJ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy1Q8BIJ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy1Q8BIJ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms