Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf4Q6PFF0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf4Q6PFF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf4Q6PFF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf4Q6PFF0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms