Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ltn1Q6A009 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ltn1Q6A009 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltn1Q6A009 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ltn1Q6A009 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ltn1Q6A009 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ltn1Q6A009 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ltn1Q6A009 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms