Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps41Q5KU39 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps41Q5KU39 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps41Q5KU39 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps41Q5KU39 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms