Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU31

Ipcef1, Interactor protein for cytohesin exchange factors 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipcef1Q5DU31 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ipcef1Q5DU31 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipcef1Q5DU31 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ipcef1Q5DU31 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms