Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV71

Tmtc1, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc1Q3UV71 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmtc1Q3UV71 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmtc1Q3UV71 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmtc1Q3UV71 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmtc1Q3UV71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmtc1Q3UV71 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc1Q3UV71 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc1Q3UV71 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc1Q3UV71 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc1Q3UV71 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc1Q3UV71 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc1Q3UV71 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmtc1Q3UV71 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmtc1Q3UV71 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms