Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cobll1Q3UMF0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cobll1Q3UMF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cobll1Q3UMF0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cobll1Q3UMF0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cobll1Q3UMF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms