Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43aQ3TL54 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim43aQ3TL54 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim43aQ3TL54 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms