Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp8Q2V6D6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp8Q2V6D6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp8Q2V6D6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp8Q2V6D6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms