Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lemd1Q14C37 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lemd1Q14C37 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lemd1Q14C37 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lemd1Q14C37 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lemd1Q14C37 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lemd1Q14C37 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lemd1Q14C37 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lemd1Q14C37 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lemd1Q14C37 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lemd1Q14C37 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lemd1Q14C37 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms