Protein–RNA interactions for Protein: Q08235

BRX1, Ribosome biogenesis protein BRX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1Q08235 MRP1YDR347W 966 nt6.97□□□□□ -1.29
BRX1Q08235 AIM3YBR108W 2844 nt6.96□□□□□ -1.29
BRX1Q08235 ELP4YPL101W 1371 nt6.96□□□□□ -1.29
BRX1Q08235 SSC1YJR045C 1965 nt6.95□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 DST1YGL043W 930 nt6.95□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 TES1YJR019C 1050 nt6.95□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 CDA1YLR307W 906 nt6.95□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 ECM30YLR436C 3825 nt6.95□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 YOR389WYOR389W 1875 nt6.95□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 PPS1YBR276C 2424 nt6.95□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.94□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 CPR2YHR057C 618 nt6.94□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 MET13YGL125W 1803 nt6.93□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 PAU21YOR394W 495 nt6.93□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 PAU22YPL282C 495 nt6.93□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 AOS1YPR180W 1044 nt6.93□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 TPO1YLL028W 1761 nt6.92□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 AVL9YLR114C 2295 nt6.92□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 PMT1YDL095W 2454 nt6.91□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 CKB1YGL019W 837 nt6.91□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 HRA1HRA1 564 nt6.91□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 HAM1YJR069C 594 nt6.91□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 PSP2YML017W 1782 nt6.9□□□□□ -1.3
BRX1Q08235 PRB1YEL060C 1908 nt6.89□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 HGH1YGR187C 1185 nt6.89□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 ERP2YAL007C 648 nt6.89□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 MGM101YJR144W 810 nt6.89□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 ADE1YAR015W 921 nt6.89□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 NUP53YMR153W 1428 nt6.89□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 HXT9YJL219W 1704 nt6.88□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 RSC9YML127W 1746 nt6.88□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 SPR1YOR190W 1338 nt6.88□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.88□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 YHR033WYHR033W 1272 nt6.88□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 STE3YKL178C 1413 nt6.87□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 YOR343CYOR343C 327 nt6.87□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 PNS1YOR161C 1620 nt6.87□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.86□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.86□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.86□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.86□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.86□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.86□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.86□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 CPT1YNL130C 1182 nt6.86□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 PEX28YHR150W 1740 nt6.86□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 FRE5YOR384W 2085 nt6.86□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 BNA3YJL060W 1335 nt6.85□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 HAC1YFL031W 717 nt6.85□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 TOS1YBR162C 1368 nt6.84□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 SGF73YGL066W 1974 nt6.84□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 YNL295WYNL295W 1575 nt6.84□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 RRP43YCR035C 1185 nt6.84□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 YJL043WYJL043W 774 nt6.84□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 BUD20YLR074C 501 nt6.84□□□□□ -1.31
BRX1Q08235 PDC5YLR134W 1692 nt6.84□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 FET4YMR319C 1659 nt6.84□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 TPK1YJL164C 1194 nt6.83□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 PET10YKR046C 852 nt6.83□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 GYP8YFL027C 1494 nt6.83□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.82□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 INP54YOL065C 1155 nt6.82□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 EMP65YER140W 1671 nt6.81□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 YER137CYER137C 447 nt6.81□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.81□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 HMS2YJR147W 1077 nt6.81□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 YPC1YBR183W 951 nt6.81□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 VMA2YBR127C 1554 nt6.81□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 RUP1YOR138C 2016 nt6.81□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 YDR476CYDR476C 675 nt6.8□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 ERV25YML012W 636 nt6.8□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 LEO1YOR123C 1395 nt6.8□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 YDR215CYDR215C 414 nt6.79□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 RRT6YGL146C 936 nt6.79□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.79□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 FUS3YBL016W 1062 nt6.79□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 DAL80YKR034W 810 nt6.78□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 MEU1YLR017W 1014 nt6.78□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 SNF7YLR025W 723 nt6.78□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 VPS65YLR322W 315 nt6.78□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 ERV2YPR037C 591 nt6.78□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 NMT1YLR195C 1368 nt6.78□□□□□ -1.32
BRX1Q08235 SLX5YDL013W 1860 nt6.77□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 PSA1YDL055C 1086 nt6.77□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 GET2YER083C 858 nt6.77□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 SNA3YJL151C 402 nt6.77□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 CAR2YLR438W 1275 nt6.77□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 CBK1YNL161W 2271 nt6.76□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 STS1YIR011C 960 nt6.76□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 PET494YNR045W 1470 nt6.75□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 PPZ2YDR436W 2133 nt6.75□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 OPI1YHL020C 1215 nt6.75□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 YPT10YBR264C 600 nt6.75□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 SPS1YDR523C 1473 nt6.74□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 RPL12BYDR418W 498 nt6.74□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 SKY1YMR216C 2229 nt6.74□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 YJR142WYJR142W 1029 nt6.73□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 YBL070CYBL070C 321 nt6.73□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 YBL113CYBL113C 2379 nt6.73□□□□□ -1.33
BRX1Q08235 NCA3YJL116C 1014 nt6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms