Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 BIM1YER016W 1035 nt6.05□□□□□ -1.44
ATG39Q06159 YGR137WYGR137W 375 nt6.05□□□□□ -1.44
ATG39Q06159 WSC3YOL105C 1671 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG39Q06159 RQC1YDR333C 2172 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG39Q06159 MAL31YBR298C 1845 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG39Q06159 MFT1YML062C 1179 nt6.04□□□□□ -1.44
ATG39Q06159 HXT8YJL214W 1710 nt6.03□□□□□ -1.44
ATG39Q06159 PRE10YOR362C 867 nt6.03□□□□□ -1.44
ATG39Q06159 MRP7YNL005C 1116 nt6.02□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 TIM50YPL063W 1431 nt6.01□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 PMT1YDL095W 2454 nt6.01□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 UTR5YEL035C 501 nt6.01□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 ALG7YBR243C 1347 nt6□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 RMD8YFR048W 1989 nt6□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 GPA1YHR005C 1419 nt6□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 ARO3YDR035W 1113 nt6□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 PMU1YKL128C 888 nt6□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 VMA2YBR127C 1554 nt6□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 ATP2YJR121W 1536 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 JHD1YER051W 1479 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 SEC23YPR181C 2307 nt5.99□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 RRN10YBL025W 438 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 ADA2YDR448W 1305 nt5.98□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 YER152W-AYER152W-A 567 nt5.97□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 GNA1YFL017C 480 nt5.97□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 CKB1YGL019W 837 nt5.97□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 YOR041CYOR041C 432 nt5.97□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 KIN1YDR122W 3195 nt5.96□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 RGT2YDL138W 2292 nt5.96□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 RUP1YOR138C 2016 nt5.96□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 TKL2YBR117C 2046 nt5.96□□□□□ -1.45
ATG39Q06159 EFM1YHL039W 1758 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 GRH1YDR517W 1119 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 SNP1YIL061C 903 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 ERP2YAL007C 648 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 DPH5YLR172C 903 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 ARG7YMR062C 1326 nt5.96□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 PDC5YLR134W 1692 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 AVL9YLR114C 2295 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 TDH1YJL052W 999 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 NOG2YNR053C 1461 nt5.95□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 PEX28YHR150W 1740 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 YIL168WYIL168W 384 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 TES1YJR019C 1050 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 CDA1YLR307W 906 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 AIM3YBR108W 2844 nt5.94□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 YJR154WYJR154W 1041 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 MNN9YPL050C 1188 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 GDH1YOR375C 1365 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 ELP4YPL101W 1371 nt5.93□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 MRP1YDR347W 966 nt5.92□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 PAC10YGR078C 600 nt5.92□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 HRA1HRA1 564 nt5.92□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 TAD2YJL035C 753 nt5.92□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 CDC23YHR166C 1881 nt5.92□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 YBR284WYBR284W 2394 nt5.91□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 FPR2YDR519W 408 nt5.91□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 ELP6YMR312W 822 nt5.91□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 SMK1YPR054W 1167 nt5.91□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 MTC6YHR151C 1581 nt5.91□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 HXT2YMR011W 1626 nt5.91□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 FRE5YOR384W 2085 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 HHY1YEL059W 309 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 PAU21YOR394W 495 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 PAU22YPL282C 495 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG39Q06159 TOS1YBR162C 1368 nt5.9□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 GTS1YGL181W 1191 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 ENB1YOL158C 1821 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 YHR131CYHR131C 2553 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 GTT3YEL017W 1014 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 GLN3YER040W 2193 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 CYC8YBR112C 2901 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 DST1YGL043W 930 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 AOS1YPR180W 1044 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 CAN1YEL063C 1773 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 PSP2YML017W 1782 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 SLX5YDL013W 1860 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 NUP53YMR153W 1428 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 CPR2YHR057C 618 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 HAM1YJR069C 594 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 HAL5YJL165C 2568 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 FLC2YAL053W 2352 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 HGH1YGR187C 1185 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 ADE1YAR015W 921 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 YNL200CYNL200C 741 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 YOR012WYOR012W 414 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 GYP8YFL027C 1494 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 LEO1YOR123C 1395 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 SNF7YLR025W 723 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 BUD20YLR074C 501 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 YOR343CYOR343C 327 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG39Q06159 YBL113CYBL113C 2379 nt5.84□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 NMT1YLR195C 1368 nt5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 83.7 ms