Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx2Q00262 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx2Q00262 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx2Q00262 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx2Q00262 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx2Q00262 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx2Q00262 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx2Q00262 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx2Q00262 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx2Q00262 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx2Q00262 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx2Q00262 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms