Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga11P61622 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga11P61622 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga11P61622 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga11P61622 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga11P61622 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga11P61622 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga11P61622 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga11P61622 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga11P61622 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga11P61622 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga11P61622 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga11P61622 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga11P61622 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga11P61622 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga11P61622 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga11P61622 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms