Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Itga11P61622 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Itga11P61622 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Itga11P61622 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Itga11P61622 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Itga11P61622 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Itga11P61622 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Itga11P61622 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Itga11P61622 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Itga11P61622 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Itga11P61622 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Itga11P61622 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Itga11P61622 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Itga11P61622 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Itga11P61622 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Itga11P61622 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Itga11P61622 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Itga11P61622 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Itga11P61622 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Itga11P61622 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Itga11P61622 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Itga11P61622 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Itga11P61622 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Itga11P61622 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Itga11P61622 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Itga11P61622 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Itga11P61622 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Itga11P61622 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Itga11P61622 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Itga11P61622 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Itga11P61622 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Itga11P61622 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Itga11P61622 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Itga11P61622 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Itga11P61622 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Itga11P61622 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Itga11P61622 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Itga11P61622 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Itga11P61622 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Itga11P61622 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Itga11P61622 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Itga11P61622 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Itga11P61622 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Itga11P61622 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Itga11P61622 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Itga11P61622 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Itga11P61622 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Itga11P61622 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Itga11P61622 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Itga11P61622 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Itga11P61622 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Itga11P61622 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Itga11P61622 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Itga11P61622 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Itga11P61622 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Itga11P61622 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Itga11P61622 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Itga11P61622 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Itga11P61622 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Itga11P61622 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Itga11P61622 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Itga11P61622 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Itga11P61622 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Itga11P61622 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Itga11P61622 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Itga11P61622 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Itga11P61622 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Itga11P61622 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Itga11P61622 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Itga11P61622 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Itga11P61622 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Itga11P61622 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Itga11P61622 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Itga11P61622 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Itga11P61622 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Itga11P61622 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Itga11P61622 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Itga11P61622 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Itga11P61622 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Itga11P61622 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Itga11P61622 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Itga11P61622 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itga11P61622 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Itga11P61622 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Itga11P61622 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Itga11P61622 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Itga11P61622 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Itga11P61622 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Itga11P61622 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Itga11P61622 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Itga11P61622 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Itga11P61622 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Itga11P61622 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Itga11P61622 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Itga11P61622 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Itga11P61622 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Itga11P61622 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Itga11P61622 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Itga11P61622 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Itga11P61622 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.9 ms