Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CirbpP60824 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CirbpP60824 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CirbpP60824 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CirbpP60824 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CirbpP60824 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CirbpP60824 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CirbpP60824 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CirbpP60824 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CirbpP60824 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CirbpP60824 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CirbpP60824 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CirbpP60824 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CirbpP60824 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CirbpP60824 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CirbpP60824 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CirbpP60824 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CirbpP60824 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms